Такой строкой скрипт запуска MySQL рассказывает. что он:
- Проверяет наличие поврежденный таблиц
- Проверяет наличие не закрытых таблиц
- Проверяет наличие не обновленных таблиц, если вы обновили версию MySQL.
Можно принудительно проверить вcе таблицы для спокойствия
mysqlcheck --check-upgrade --all-databases --auto-repair -u root -p mysql_upgrade --force -u root -p |
http://wiki.hasanov.ru/ubuntu/checking_for_corrupt_not_cleanly_closed_and_upgrade_needing_tables